“撤點并校”的支持者們提出的一個合理理由就是，并校后農(nóng)村學(xué)生可以享受到更多城鎮(zhèn)學(xué)校的教育資源，而學(xué)校向縣、鄉(xiāng)集中，帶來的直接后果是城鎮(zhèn)出現(xiàn)學(xué)生人數(shù)很多的巨型學(xué)校和巨型班級，這嚴重影響了教學(xué)質(zhì)量。

　　農(nóng)村小學(xué)分為“教學(xué)點”和“完小”：“教學(xué)點”一般四年級以下，完小到五年級或到六年級，“撤點并校”最主要的就是合并“教學(xué)點”，所以很多低齡的小學(xué)生被波及。七八隨的孩子就要遠離父母，在學(xué)校里獨立生活，也不利于孩子心理上的健康成長。

　　因為“撤點并校”是以生源不足、教育資源利用率低為理由，所以一些人口稀疏的貧困山區(qū)的小學(xué)的合并力度最大，政策實施者將撤除偏遠小學(xué)、集中辦學(xué)看成是現(xiàn)代化教育的表現(xiàn)，這為孩子、父母造成了極大的不便和負擔(dān)。

　　或許政府財政因此減少了辦學(xué)成本，但農(nóng)民的負擔(dān)增加了。并校后許多原來就近上學(xué)的學(xué)生產(chǎn)生了住宿費、伙食費、生活費、交通費；一些不得不異地求學(xué)的小學(xué)學(xué)生因年齡太小，家長不放心，不得不選擇陪讀，又增加了房租成本；而選擇通勤的學(xué)生，則增加了一筆交通費。

　　《2009中國教育發(fā)展報告》中“中國中西部地區(qū)農(nóng)村寄宿制調(diào)查”指出，在中部地區(qū)，每個農(nóng)村家庭因寄宿而額外增加的費用平均為657.3元/年。在西部，這個數(shù)字是787.8元/年。而一些西部貧困地區(qū)家庭的人均年收入也才一兩千元。

　　這些都加重了農(nóng)村孩子輟學(xué)的可能，香港樂施會曾聯(lián)合貴州大學(xué)、廣西大學(xué)及陜西省社科院共同對三省的農(nóng)村學(xué)校進行過調(diào)查，結(jié)果顯示在實行“撤點并校”之后，當(dāng)?shù)剞r(nóng)村學(xué)齡兒童的輟學(xué)率都有不同程度的反彈。